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CRISPR-Cas9の分子機構とゲノム編集ツールの開発・物理チャネルの分子機構
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分裂酵母が独特の核膜孔複合体アウターリング構造を持つことを解明
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2019年05月13日（月）16:00〜17:00 Imaging How Cells Choose their Fate, Shape and Position in the Mammalian Embryo
シンガポールA*STARのNicolas Plachta博士によるセミナーを開催します。Plachta博士は、精緻なライブイメージングを駆使することで、着床前マウス胚の発生における、転写因子、細胞骨格・細胞間接着、細胞配置などについて、数々の新規の発見をされてきました。来日に合わせてセミナーをしていただけることになりました。皆様のご来場をお待ちしています。
Date/Time
May 13, 2019 (Mon), 16:00-17:00
Place
2F Seminar Room, BioSystems Building
Speaker
Dr. Nicolas Plachta (A*STAR, Singapore)
Title
Imaging How Cells Choose their Fate, Shape and Position in the Mammalian Embryo
Abstract
Preimplantation development has typically been studied using fixed specimens. To reveal the real-time dynamics that form the embryo, we established advanced imaging technologies, to visualize cell behaviors and molecular events in real time within the mouse embryo. With this approach, we discovered how transcription factors bind to DNA in single cells to regulate the first cell differentiation during development. We also found new forms of actin and microtubule organization that control how the cells of the embryo become polarized during compaction, how they interact with each other to establish the first forms of tissue architecture, and how they specify the pluripotent and trophectoderm lineages. Together, our findings reveal new mechanisms controlling how the mammalian embryo forms and grows.
Reference
- Expanding Actin Rings Zipper the Mouse Embryo for Blastocyst Formation.
Zenker J, White MD, Gasnier M, Alvarez YD, Lim HYG, Bissiere S, Biro M, Plachta N.
Cell. 2018 Apr 19;173(3):776-791 - A microtubule-organizing center directing intracellular transport in the early mouse embryo.
Zenker J, White MD, Templin RM, Parton RG, Thorn-Seshold O, Bissiere S, Plachta N.
Science. 2017 Sep 1;357(6354):925-928 - Long-Lived Binding of Sox2 to DNA Predicts Cell Fate in the Four-Cell Mouse Embryo.
White MD, Angiolini JF, Alvarez YD, Kaur G, Zhao ZW, Mocskos E, Bruno L, Bissiere S, Levi V, Plachta N.
Cell. 2016 Mar 24;165(1):75-87 - Cortical Tension Allocates the First Inner Cells of the Mammalian Embryo.
Samarage CR, White MD, Álvarez YD, Fierro-González JC, Henon Y, Jesudason EC, Bissiere S, Fouras A, Plachta N.
Dev Cell. 2015 Aug 24;34(4):435-47 - Cadherin-dependent filopodia control preimplantation embryo compaction.
Fierro-González JC, White MD, Silva JC, Plachta N.
Nat Cell Biol. 2013 Dec;15(12):1424-33
Host
Hiroshi Sasaki
E-mail: sasaki[at]fbs.osaka-u.ac.jp
http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/seminar/seminar/docs/fbs-seminar-sasaki-20190513.pdf
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受精卵の中で人工細胞核構造の構築に世界で初めて成功
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バイオイメージングと質量分析イメージングの融合
日時
2019年7月9日（火）14:30〜16:00
場所
吹田キャンパス 生命システム棟 2階セミナー室
講師
- 上田昌宏（大阪大学大学院生命機能研究科 教授）
- 豊田岐聡（大阪大学大学院理学研究科 教授）
- 難波啓一（大阪大学大学院生命機能研究科 教授）
- 青木順（大阪大学大学院理学研究科 助教）
プログラム
「阪大物理の質量分析装置開発」豊田岐聡教授
大阪大学理学研究科の質量分析グループは、淺田らが1930年代後半に国内初の質量分析装置を開発して以来の長い歴史と伝統を有しています。数多くの世界最高性能を有する独創的な装置を開発し、原子質量の精密測定に始まり、生体分子などの広範囲の物質の高精度測定を可能とし、科学の発展に貢献してきました。本講演では、当グループの装置開発の歴史、さらには最近の展開について報告します。
「高空間分解能・高質量分解能を備えた投影型イメージング質量分析装置開発」青木順助教
質量分析を用いた新しい分析手法としてイメージング質量分析が普及してきています。イメージング質量分析は、質量ごとに試料表面の物質の分布を観測できる技術です。我々のグループでは、投影型のイオン光学系と多重周回飛行時間型質量分析装置を組み合わせて、これまでにない高い質量分解能と空間分解能を有するイメージング質量分析装置を開発してきました。本講演では、この装置の原理と開発状況および応用事例を紹介します。
「1分子・細胞内イメージングの開発」上田昌宏教授
細胞内で1分子の振る舞いを分析する手法（細胞内1分子イメージング解析法）は、基礎生物学と共に創薬などの応用分野の強力な分析手法となり得ます。長年の懸案であったイメージングや画像解析の効率をロボット技術と機械学習による自動化によって大幅に向上させ、網羅的分析が可能なハイスループットシステムを実現しました。開発に至る背景と細胞内シグナル伝達系への適用例を紹介します。
パネルディスカッション「イメージングの未来」上田昌宏教授・豊田岐聡教授・難波啓一教授・青木順助教
講演に基づき、現在の技術的限界や今後の技術開発による未来への期待と展望を議論します。「こんなものが見たいのだけど、どのような方法がよいのか」「今は難しいがこんなものが見えるといいな」「他の技術と組み合わせることでこんなことがわかるかも」などなど、イメージングの未来を語りましょう！
参加費
無料
対象
本学の学生・教職員、社会人・一般
申込
当日そのまま来ていただいても参加は可能ですが、参加を希望される方は、できるだけ下記リンク【申込フォーム】より事前申込をお願いいたします。
https://www.reno.osaka-u.ac.jp/event/?no=408
問い合わせ
大阪大学科学機器リノベーション・工作支援センター
E-Mail: event[at]reno.osaka-u.ac.jp
TEL/FAX: 06-6879-4781
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2019年06月21日（金）16:00〜17:30 小脳における運動情報と非運動情報
日時
2019年6月21日（金）16:00〜17:30
場所
吹田キャンパス 生命機能研究科 生命システム棟2階 セミナー室
演者
喜多村和郎（山梨大学大学院総合研究部）
演題
小脳における運動情報と非運動情報
要旨
小脳は、運動制御や運動学習に重要な脳領域として、これまで、眼球運動や瞬目反射、到達運動等における役割が詳細に解析されてきた。適応的な運動制御を可能にするためのメカニズムとして小脳シナプス可塑性（LTD）や小脳内部モデルが提唱され、それを支持する結果が積み重ねられてきた。特に、LTDや内部モデルの機能を制御する誤差または教師信号としてはたらくとされる登上線維シグナルが運動の何をどのように表現しているのかについて、明らかにされている。一方、小脳は末梢のみならず、多くの大脳皮質領域や基底核、脳幹神経核と相互連絡があり、運動機能に限らず多様な情報をやりとりしていると考えられる。特に最近、小脳にも運動準備や報酬に関連する活動があることが次々に報告されている。我々は、2光子イメージング法を用いた神経活動記録により、認知運動課題を実行中のマウス小脳における運動情報表現や、多様な情報表現のマッピングを行っている。セミナーでは、これらの結果とともに最近の小脳研究について紹介する。
世話人
山本亘彦
Tel: 06-6879-4636
E-mail: nobuhiko@fbs.osaka-u.ac.jp
http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/seminar/seminar/docs/fbs-seminar-yamamoto-20190621.pdf
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着床前胚での細胞同士のコミュニケーションで高品質に！？
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クライオ電子顕微鏡による生体試料の構造解析 〜主にべん毛モーター〜
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自分たちで作る光学顕微鏡とその応用
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※2020年度５年一貫制博士課程募集要項の誤りについて
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2019年06月28日（金）16:00〜 Multi-color imaging of non-canonical translation dynamics with single molecule resolution in living cells
Date/Time
June 28, 2019 (Fri), 16:00-
Place
2F Seminar Room, BioSystems Building
Speaker
Timothy J. Stasevich, Ph.D. (Colorado State University)
Title
Multi-color imaging of non-canonical translation dynamics with single molecule resolution in living cells
Abstract
My lab is developing technology to image with high spatiotemporal resolution the dynamics of single mRNA translation in living cells. In this talk, I'll describe recent multicolor extensions of our technology to image non-canonical translation. First, I'll describe how complementary repeat epitopes can be placed in overlapping translation reading frames to monitor single RNA translation frameshifting [1]. Application to HIV-1 reveals frameshifting occurs only on a subset of RNA in stimulated bursts that last for many rounds of translation. Mathematical modeling of the data provides new insight into how frameshifting occurs at the single molecule level, implicating ribosomal traffic jams in maintaining the frameshifting state, even when global translation initiation is inhibited. Second, I'll describe unpublished work examining IRES-mediated translation. By inserting complementary epitopes into a bicistronic reporter, cap and IRES mediated translation from a single RNA can be simultaneously monitored in real-time. Using this sensor, we find the EMCV IRES recruits approximately one ribosome for every three ribosomes recruited to the cap. Upon cellular stress, however, this balance dramatically shifts in favor of the IRES. Interestingly, even in unstressed conditions, we find evidence for crosstalk between IRES and cap-mediated translation, implying ribosome recycling from cap to IRES often occurs. Finally, I'll discuss new genetically-encoded imaging reagents we created to facilitate "live-cell immunofluorescence" of small epitope tags like HA [2] and FLAG. These reagents are cheap and easy to use and should therefore make multicolor imaging of single RNA translation more widespread.
Reference
- K. Lyon, L. U. Aguilera, T. Morisaki, B. Munsky, and T. J. Stasevich
Live-Cell Single RNA Imaging Reveals Bursts of Translational Frameshifting
Molecular Cell 75, 1-12, 2019
https://doi.org/10.1016/j.molcel.2019.05.002 - N. Zhao, K. Kamijo, P. D. Fox, H. Oda, T. Morisaki, Y. Sato, H. Kimura, T. J. Stasevich
A genetically encoded probe for imaging nascent and mature HA-tagged proteins in vivo
Nature Communications 2019
(in press, preprint on biorxiv: doi: https://doi.org/10.1101/474668).
Host
Yasuhiro Hirano
Tel: 06-6879-4621
E-mail: yhira[at]fbs.osaka-u.ac.jp
http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/seminar/seminar/docs/fbs-seminar-hiraoka-20190628.pdf
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2019年7月12日（金）14:00〜 LEICA新世代イメージング法
日時
2019年7月12日（金）14:00〜
場所
吹田キャンパス 生命機能研究科 生命システム棟2階 セミナー室
演者
伊集院敏（ライカマイクロシステムズ株式会社）
問い合わせ
伊集院敏（ライカマイクロシステムズ株式会社）
03-6758-5640
satoshi.ijuin(a)leica-microsystems.co.jp
（送信時には(a)を@に変えてください）
http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/seminar/other/docs/event-20190712.pdf
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2019年07月12日（金）16:30〜18:00 嗅覚系をモデルシステムとした神経回路形成機構の解明
日時
2019年7月12日（金）16:30〜18:00
場所
吹田キャンパス 生命機能研究科 ナノバイオロジー棟3階 セミナー室
演者
中嶋藍（東京大学大学院薬学系研究科）
演題
嗅覚系をモデルシステムとした神経回路形成機構の解明
要旨
高等動物の神経回路は、遺伝的プログラムによる基本的なシステム構築に加えて、臨界期に生じる神経活動による精緻化を経て完成される。「三つ子の魂百まで」という格言にあるように、発達期における神経細胞の適切な活動とそれに伴う回路の成熟は、その後の我々の高度な行動・機能発現に極めて重要な役割を果たすことが知られている。一方で、電気パルスのオン・オフで表される神経活動がどのようにして神経細胞の複雑かつ精緻なネットワークを構築しているのかについては、「神経活動の同期性にしたがって神経回路形成が行なわれる」というヘブ則が提唱されている以外には長い間謎のままであった。私たちの研究グループでは、嗅覚系をモデル系として嗅神経細胞(嗅細胞)が嗅球上に織りなす神経回路の構築メカニズムの解明を目指して神経活動の観察と操作を行ってきた。GCaMP6fを用いた神経活動の観察により、接続先を同じくする嗅細胞の集団は同様の神経活動のパターンを示す一方で、接続先の異なる嗅細胞集団は異なる神経活動パターンを示すことを見出した。さらに光遺伝学的手法を用いて人為的に神経活動パターンの操作を行った結果、神経活動パターンが回路構築に関わるタンパク分子（軸索選別分子）の特異的な発現を制御して嗅神経回路の形成を指令していることが示唆された。これらの結果は、嗅細胞の回路構築は、神経活動パターンという情報に基づいて行なわれることが明らかとなった。さらに、異なる神経活動パターンは、異なる軸索選別分子の発現を活性化することから、嗅細胞は多様な神経活動パターンによって個々の神経細胞の個性を反映した多様な「分子コード」を作り出すことで複雑かつ精緻な回路構築が可能にしていると考えられる。この発見は長い間支配的であったヘブ則とは異なる神経活動依存的な新奇メカニズムの存在を意味しており、嗅覚系のみならず他の脳領域においても複雑なネットワークを構築する仕組みとして敷衍できる可能性があると期待される。
世話人
山本亘彦
Tel: 06-6879-4636
E-mail: nobuhiko@fbs.osaka-u.ac.jp
http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/seminar/seminar/docs/fbs-seminar-yamamoto-20190712.pdf
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2019年07月16日（火）16:00〜 Deciphering species-specific properties of human corticogenesis.
Date/Time
July 16, 2019 (Tue), 16:30-18:00
Place
3F Seminar Room, Nanobiology Building
Speaker
Dr. Pierre Vanderhaeghen (University of Brussels)
Title
Deciphering species-specific properties of human corticogenesis.
Abstract
The human brain and most strikingly the cerebral cortex has undergone rapid expansion and increased complexity during recent hominid evolution. One striking feature of human corticogenesis is that it is highly protracted in time, from early steps of expansion of progenitor pools and neurogenesis, to later stages of neuronal maturation and wiring. This protracted timing is thought to contribute in an important fashion to several key features of the human brain, such as cortical size and complexity. In vitro pluripotent stem cell-based models and in vivo mouse - human chimeric brain experiments indicate that the species-specific temporal patterning of key steps of corticogenesis is largely intrinsic to cortical progenitors and neurons. The underlying molecular mechanisms start to be uncovered, and include species-specific transcriptional programmes and cellular properties.
Host
Nobuhiko Yamamoto
Tel: 06-6879-4636
E-mail: nobuhiko[at]fbs.osaka-u.ac.jp
http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/seminar/seminar/docs/fbs-seminar-yamamoto-20190716.pdf
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G0S2タンパク質分解を標的としたATP産生増強剤の開発
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2019年8月20日（火）13:00〜14:00 新型対物レンズX Line搭載共焦点レーザー顕微鏡FV3000セミナー
日時
2019年8月20日（火）13:00〜14:00
場所
吹田キャンパス 生命機能研究科 生命システム棟2階 セミナー室
問い合わせ
近野智行（オリンパスメディカルサイエンス販売株式会社）
06-6150-0118
tomoyuki_chikano(a)ot.olympus.co.jp
（送信時には(a)を@に変えてください）
http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/seminar/other/docs/event-20190820.pdf
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Career path talk
研究セミナー後には、NIHを中心としてグラント（科研費）の仕組みがどうなっているか、また研究者として独立をして仕事を進めて行く上での研究費の獲得に至るまでや、ラボ運営の経済事情についての講演を別枠で行っていただけました。
NIHのグラントの審査の仕組みについては、現地でPIとして研究グループを牽引されておられる方としての、臨場感溢れるお話でした。RO1グラント審査のファーストステップ、スタディセクションはどのようになっているか、どのように審査が進むのかの話も具体的に伺いました。
3人のレビューアーに9段階に分けて詳細にスコアリングされ、申請者に詳しくフィードバックされること、どれもが芳しくなければディスカッションにすら回してもらえない現実があるなど、仕組みは日本よりプラクティカルです。
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また、若手の研究者にはNew InvestigatorやEarly stage investigatorとして上記申請時、ポイント付加があること、ポスドクからステップアップのためのKグラントが準備されている等、駆け出し研究者への支援の仕組みもあるようです。
なお、NIHのレポートでは各研究者のグラント獲得状況もPubMedで調べられるとのことです。研究のアクティビティとしての論文業績とともに、経済事情についても、アメリカを中心としたポスドク先を探す上で参考な要素の一つにはなり得るかもしれません。
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厳しいながらも仕組みがフェアで透明性のあるグラント審査システムが、アメリカのアカデミアの層の厚みに繋がっていることが感じられるセミナーでした。
（企画室 岡本）
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2019年07月08日（月） FBSカフェ「研究生活で役立つ伝わるデザイン」実施報告を追加しました。
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2019年07月19日（金） FBSコロキウム217「Expression and function of cyclic phosphate-containing RNAs: a hidden layer of the transcriptome」実施報告を追加しました。
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2019年07月23日（火）15:30〜17:00 細胞認識性バイオマテリアルによる再生医療の革新
日時
2019年7月23日（火） 15:30〜17:00
場所
吹田キャンパス 生命機能研究科 生命システム棟2階 セミナー室
演者
赤池敏宏（公益財団法人国際科学振興財団）
演題
細胞認識性バイオマテリアルによる再生医療の革新
要旨
私たちは化学的手法あるいは遺伝子工学手法を用いて作製した人工的な高分子・蛋白質分子を細胞の足場としての応用を追求してきた。すなわち新たな細胞認識型のバイオマテリアルとしての応用を展開してきた。本来細胞の足場となり得ない細胞間接着分子や増殖因子・サイトカイン・被貪食性リガンド等々を細胞の足場として利用することで，細胞機能の制御，さらには各種幹細胞の培養・分化誘導法へ応用展開した。細胞間接着分子であるE、N、VE等、各種カドヘリンの分子の発現とその役割の解明については、わが国の竹市雅俊教授グループの1980年代以降の優れた研究がある。私たちの研究グループは細胞認識性バイオマテリアルとして、2001年以来カドヘリンマトリックス工学を提唱・展開した。E、N、VEの各種膜タンパク質、カドヘリン分子（一部に水溶性の各種サイトカイン、細胞増殖因子）の頭部を抗体分子の尾部Fcとキメラ化した両親媒性人工タンパクを設計した。これらはかって私たちの研究グループがオリジナルな細胞認識材料とし設計・応用展開してきたPVLA等の各種界面活性型糖質高分子とほぼ同様の界面物性を示し、組織工学、再生医療と各種臓器線維症をはじめとしたターゲットへのDDSに向けて応用展開が期待される。
世話人
明石満
Tel: 06-6105-5247
E-mail: akashi@fbs.osaka-u.ac.jp
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