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2016年07月25日(月)開催 "Activity-regulated transcription program underlying homeostatic synaptic plasticity"Tae-Kyung Kim, Ph.D. (Department of Neuroscience, UT Southwestern Medical Center)

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All are welcome to attend.

Date/Time

July 25, 2016 (Mon), 16:00-17:00

Place

2F Seminar room, BioSystems Building

Speaker

Tae-Kyung Kim, Ph.D. (Department of Neuroscience, UT Southwestern Medical Center)

Title

Activity-regulated transcription program underlying homeostatic synaptic plasticity

Abstract

Homeostatic plasticity represents the fundamental cellular mechanism by which neurons and neural networks stably maintain their activity within a functional dynamic range in the face of perturbing force or activity. Global synaptic scaling is a form of homeostatic synaptic plasticity that adjusts synaptic strengths bi-directionally to stabilize average neuronal firing rates in the cases of altered neural activity. It occurs cell-autonomously over a chronic time scale and requires nuclear transcription. However the nature of the transcription program and associated signaling pathways that underlie synaptic scaling have not been well defined. We have been interested in understanding the nature of the transcription program that specifically operates to promote the cell-wide response for up-regulating synaptic strength when neuronal activity is chronically suppressed. We have applied various genome-wide approaches to systematically identify and characterize the molecular nature of this transcription program. We have also investigated how calcium signaling specifies gene induction and whether the genes that are induced by chronic activity suppression are functionally important for mediating synaptic scaling.

Host

Nobuhiko Yamamoto


2016年07月26日(火)開催 "3D analysis of axon guidance in transparent vertebrate embryos: of mice and men"Dr. Alain Chédotal (Vision Institute, Paris, France)

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All are welcome to attend.

Date/Time

July 26, 2016 (Tue), 16:00-17:00

Place

2F Seminar room, BioSystems Building

Speaker

Dr. Alain Chédotal (Directeur de Recherche INSERM, coordinator of the Department of Development, group leader, INSERM U968, Vision Institute, Paris, France)

Title

3D analysis of axon guidance in transparent vertebrate embryos: of mice and men

Abstract

In all vertebrates, commissural axons project across the midline of the nervous system to targets on the opposite side. The appearance and modification of commissural circuits has accompanied the emergence of key neurobiological features in vertebrate evolution, such as depth perception, hearing and limb-derived locomotion. Therefore, while vertebrate brains share a common overall architecture, many neuroanatomical differences can readily be observed, as well as differences in their ability to perform specific tasks.

Robo receptors play a major role in the control of axon guidance at the midline of the central nervous system. In vertebrates, a divergent Robo family member Robo3 is expressed by commissural axons of the mouse spinal cord and hindbrain before and during crossing of the ventral midline (the floor plate), and many commissures fail to develop in mice and humans lacking Robo3. We found that the Robo3 receptor fundamentally changed its mechanism of action during mammalian evolution. Interestingly, we found that the Netrin-1 receptor DCC does not exist in all vertebrates. Overall, our results suggest that commissural axon guidance mechanisms may be more diverse across species than previously appreciated. This illustrates how adaptive changes in an axon guidance receptors can lead to fundamental changes in its function and distinct neuronal circuits, helping to understand the emergence of specific sensory, motor and cognitive functions and why they differ between species.

To facilitate the analysis of commissural systems in vertebrates, we have developed a new imaging method which combines whole-mount immunostaining, tissue clearing and light-sheet microscopy. I will present new applications of this method to provide the first comprehensive description of development in human embryos during the first trimester of gestation.

Host

Fujio Murakami & Nobuhiko Yamamoto

2016年07月27日(水) あらたに、卒業生からのメッセージが届きました。

第143回生命機能研究科研究交流会2016年9月28日(水)12時15分~13時講演:石飛 秀和 先生(生命機能研究科・ ナノ・バイオフォトニクス研究室(井上研・准教授)

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【講演案内】

演者: 石飛 秀和

所属: 生命機能研究科 ・ ナノ・バイオフォトニクス研究室(井上研)    

演題: 「金属ナノ粒子のプラズモン共鳴を利用した光ナノ計測」    

要旨: 

当研究室で開発中の金属ナノ粒子のプラズモン共鳴を利用した
光ナノ計測の原理について説明します。また転写機構による
DNA構造変化を測定した応用例を紹介します。


世話人氏名 :石飛 秀和

Tel 06-6879-4617

E-mailishitobi@ap.eng.osaka-u.ac.jp


平成29年度(2017年度)5年一貫制博士課程入学(4月入学)合格者受験番号一覧

平成28年度(2016年度)3年次編入学(10月入学)合格者受験番号一覧

難波研究室が立命館高校とKorea Science Academy高校の合同見学を受け入れました。

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7月15日、先日に引き続き、立命館高校のSSH(スーパーサイエンス高校)の国際交流プログラムの一環として、Korea Science Academy of KAISTから7名の高校生が来日され、立命館高校生と合わせて30名の生徒および教職員4名が本研究科、難波研究室を見学されました。

難波教授の講義に始まり、4グループに分かれて電子顕微鏡の試料観察、クライオ電子顕微鏡見学、光学顕微鏡によるサルモネラ菌の遊泳観察やべん毛付着ビーズによるモーターの回転観察などが行われました。

講義では細胞の中の小さなナノマシンがいかに、巧妙に効率的に創り上げられているかを分子アニメーションやわかりやすい例えを交えて示され、生命がいかにしなやかに緻密なしくみを持ってつくられているかといった話に、生徒さん達は熱心に耳を傾けておられました。会全体は英語での対応でしたが、クライオ電顕の圧倒的な存在感に、生徒さんからは内部のしくみや画像解析等ついて、大学院生顔負けの質問もあり、熱の籠った見学会でした。科学者の卵たちがいたかもしれません。

(企画室 岡本)

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神戸高校サイエンスツアーを取材しました。

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7月21日、平岡先生を中心として神戸高校のサイエンスツアーが開催されました。平岡先生のご出身高校ということで、受け入れが10年ほど続いているそうです。

今年は47名の生徒さんと引率の先生が6、7名来学されました。

今回の参加ツアーは6コース設定されており、1)細胞核ダイナミクス研究室、2)プロトニックナノマシン研究室、3)Cinet(高磁場MRI施設)、4)ダイナミックブレインネットワーク研究室、5)光物性研究室、6)レーザーエネルギー学研究センターからグループごとに2コースを選んで見学する形に設定されていました。

1)では蛍光顕微鏡を使って、GFP蛍光ラベルした細胞を直接観察し、2)では精製タンパク質試料の電子顕微鏡観察や、電子顕微鏡施設の見学が行われ、みなさん、目を輝かせていました。

2)の見ている試料をあてるクイズではどのグループも正解で、参加者の真剣さが伝わってきました。

3)ではMRIのしくみの講義を受けたあと、実際に試料観察をして、撮った画像データも提供いただけたようです。野菜や植物のMRI画像、普段はなかなか見られるものではなくて、興味津々。4)ではプリズム順応を体感する実習や5)では光速計算(レーザー光を使った軌跡の距離と時間の計測)実習があり、データ解析をする顔は、皆研究者そのものでした。

6)は生命機能研究科外の施設の見学でした。身近な空き缶を使った分光器作りで光のプリズムを体感されたようです。

平岡先生の生命機能研究科全体にわたる生命の幅広く深い研究活動に触れられて、巧妙で精巧にできている生き物のしくみを明らかにする基礎研究の醍醐味が伝えられました。参加者の方々の将来、科学の道へつながるきっかけも芽生えたかもしれません。

(企画室 岡本)

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2016年07月15日(金)開催 難波研究室が立命館高校とKorea Science Academy高校の合同見学を受け入れました。

2016年07月21日(木)開催 神戸高校サイエンスツアーを取材しました。

F1エンジンに匹敵する回転数をもつ「べん毛モーター」のMotA分子の構造を解明

2016年08月25日(木)開催 "Brain tumor modeling using in vivo somatic gene transfer approaches"Dr. Daisuke Kawauchi (Division of Pediatric Neurooncology (B062), German Cancer Research Center (DKFZ))

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Date/Time

Aug 25, 2016 (Thu), 16:30-18:00

Place

3F Seminar Room of Nanobiology Building, Suita Campus

Speaker

Dr. Daisuke Kawauchi (Division of Pediatric Neurooncology (B062), German Cancer Research Center (DKFZ))

Title

Brain tumor modeling using in vivo somatic gene transfer approaches

Abstract

Rigid animal models of cancer are one of powerful tools for understanding of molecular mechanisms underlying how normal cells transform into malignant cells. Those models further offer us the opportunity to examine how we could prevent tumor progression with drug treatment. Despite these advantages, we often face the difficulty in generation of animal models that molecularly recapitulate human counterparts, since causal mutation(s) in cancer are usually hidden in a large number of passive mutations. While genetically engineered mouse models have utilized to identify real oncogenes and tumor suppressor genes, germline models are costly and time-consuming. To bypass these problems, I would here introduce in vivo electroporation-based somatic gene transfer methods for brain tumor modeling. In the first part, I will show the first ependymoma animal model that was caused by dysregulation of the Hippo pathway. Using transposon-based non-germline gene transduction, we developed tumors in situ under the physiologically relevant condition. The model would be a good example for preclinical studies, in which tumor growth is monitored by in vivo bioluminescence. In the second part, I will show the example of CRISPR/Cas9-engineered in vivo somatic mutations to model SHH-subgroup medulloblastoma. Using this model, I will further discuss how chromatin modifiers are involved in medulloblastoma formation. Collectively, these approaches provide a convenient platform for not only in vivo functional analysis but also effective preclinical studies, which would accelerate establishment of new therapeutic methods.

Host

Nobuhiko Yamamoto

トポロジカル近藤絶縁体の特異な2次元電子状態を発見 - 次世代半導体素子の省エネルギー化やスピントロニクス素子実現に一歩近づく成果

2016年09月15日(木)開催 "Epigenetic regulation in the mammalian subventricular zone brain stem cell niche"Dr. Francis Szele (Department of Physiology, Anatomy and Genetics, University of Oxford)

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Date/Time

Sep 15, 2016 (Thu), 17:00-18:00

Place

2F Seminar room, BioSystems Building

Speaker

Dr. Francis Szele (Department of Physiology, Anatomy and Genetics, University of Oxford)

Title

Epigenetic regulation in the mammalian subventricular zone brain stem cell niche

Abstract

Quiescent tissue specific stem cells become activated to generate rapidly proliferating transit amplifying progenitors (TAPs). The mechanisms maintaining neural stem cell (NSC) quiescence versus TAP proliferation in health and in cancer remain unclear. Isocitrate dehydrogenase 1 R132H mutations drive the growth of human gliomas. To model this, we conditionally expressed Idh1R132H in the subventricular zone (SVZ) of the adult mouse brain. Stem and transit amplifying/progenitor cells expanded and proliferation increased. SVZ cells infiltrated into surrounding brain regions. This mouse model shows that the Idh1R132H mutation drive a gliomagenic phenotype in the major adult neurogenic stem cell niche. We hypothesized that distinct epigenetic complex subunit expression and molecular targeting segregates their function in NSC versus TAPs. Our work reveals distinct Eed expression, molecular targets and functions upstream in the SVZ lineage from Ezh2, and provides novel targets for clinical therapeutics. Thus w ehave uncovered two disting and novel regulations of neurogenic stem cells.

Host

Takahisa Furukawa

"The EvoDevo & Physics of Skin Appendage and Skin Colour patterning inVertebrates"Prof. Michel C. Milinkovitch (University of Geneva, Switzerland, Group leader of Swiss Institute of Bioinformatics)

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Date/Time

Sep 8, 2016 (Thu), 14:00-15:00

Place

2F Seminar room, BioSystems Building

Speaker

Prof. Michel C. Milinkovitch (Laboratory of Artificial & Natural Evolution, Dept of Genetics & Evolution, University of Geneva, Switzerland, Group leader of Swiss Institute of Bioinformatics)

Title

The EvoDevo & Physics of Skin Appendage and Skin Colour patterning inVertebrates

Abstract

Combining evolutionary developmental biology, physics and computer science, my research group investigates the emergence of complexity and diversity of integumentary traits in vertebrates. More specifically, we perform descriptive and mechanistic analyses of morphogenesis and patterning of skin colour and skin appendages in reptiles and mammals. Using as showcases some of our recent results in snakes and lizards, I will argue that it becomes possible to understand, in non-model species, the genetic and physical determinisms of developmental processes that generate both intra- and inter-specific variation of skin traits. First, I will show that the scales on the face and jaws of crocodilians are not genetically-controlled developmental units and that their spatial patterning is generated through physical cracking of the skin. Second, I will show that rapid skin colour changes in chameleons are not caused by dispersion/aggregation of pigment-containing organelles but by the active tuning of an intracellular3D photonic structure. Third, I will discuss our analyses of skin patterning in snakes and lizards, with special emphasis on our gene mapping program in corn snakes for the identification of mutations affecting colour traits.

Host

Shigeru Kondo


http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/seminar/seminar/docs/fbs-seminar-skondo-20160908.pdf


第149回生命機能研究科研究交流会2016年11月16日(水)12時15分~13時講演:上村 陽一郎(理化学研究所、QBiC、上級研究員 /生命機能研究科招へい研究員)

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【講演案内】

演者: 上村 陽一郎(級研究員 / 阪大大学院生命機能研究科招聘研究員)

所属: 理化学研究所、QBiC、細胞シグナル動態研究グループ    

演題: 「走化性の応答レンジを調節する三量体Gタンパク質のシャトリング制御」    

要旨:

走化性とは化学物質の濃度勾配に沿った細胞運動を指し、初期発生、免疫応答など多くの生命現象で観察されます。我々が走化性研究のモデルとしている細胞性粘菌は、栄養飢餓になると自らcAMPを細胞外に放出し、それに対して走化性を示します。この細胞はわずか数%の緩やかな濃度勾配を10万倍にもわたる濃度域で検出することができます。しかし、このような走化性細胞の性質がどのように生み出されるのか、その仕組みはよくわかっていません。今回、我々は走化性の応答レンジを広げるGip1というタンパク質を見いだしました。Gip1は三量体Gタンパク質と結合することでその一部を細胞質に保持し、必要に応じて細胞膜へと送り出していました。このような三量体Gタンパク質のシャトリング制御という新たな機構により、走化性細胞は応答レンジを拡張していました。本コロキウムでは、Gip1によるGタンパク質のシャトリング機構の最新データも含めて紹介したい。


世話人:上田昌宏 (阪大大学院生命機能研究科・1分子生物学教室 教授)

Tel 06-6879-4611

E-mail:masahiroueda@fbs.osaka-u.ac.jp

5年一貫制博士課程冬季入試受験予定の方へ

2016年10月07日(金)15:00〜17:00開催 OsakaMito2016

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みなさま

下記の通り、生命機能研究科セミナーを開催いたします。みなさまのご来聴をお待ちしております。

【日時】2016年10月7日(金)15:00〜17:00

【場所】吹田キャンパス 生命機能研究科 生命システム棟2階 セミナー室

【演者】大野 伸彦 先生(生理学研究所, 愛知県岡崎市)
【演題】「有髄軸索のミトコンドリア動態制御とその破綻」

【演者】瀬崎 博美 先生(ジョンズホプキンス大, USA)
【演題】「脂質によるミトコンドリア分裂の制御」

※講演終了後は、生命システム棟2階ラウンジにて、意見交換会を開催します。奮ってご参加ください(ソフトドリンクとお菓子をご用意しています)。

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世話人 生命機能研究科ミトコンドリア動態学研究室
    准教授 岡本 浩二
    Tel: 06-6879-7970
    E-mail: kokamoto@fbs.osaka-u.ac.jp
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http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/seminar/seminar/docs/fbs-seminar-okamoto-20161007.pdf

オートファジー抑制因子Rubiconが肝臓内の脂肪蓄積と肝障害を引き起こす - 脂肪肝の発症メカニズムを解明

研究生の募集

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入学日は、原則として4月1日または10月1日で、在学期間は入学日から当該年度の末日までです。

引き続き研究生として在籍する場合は、延長手続きを取る必要があります(別途通知)。

出願期間は、入学予定日の1ヶ月前までです。

平成29年度 募集要項

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